Muğla Sıtkı Koçman Üniversitesi lisans programlarına kabul, Türkiye'de yükseköğretimi düzenleyen kurallara dayanır. Yükseköğrenim hakkı Öğrenci Seçme ve Yerleştirme Merkezi yılda bir kez ülke çapında düzenlenen Üniversiteye Giriş Sınavı ile verilir. Sınava girerek bir yerleşim hakkı kazanan ve tercihlerini Muğla Sıtkı Koçman Üniversitesi ile yapanlar fakültelere ve yüksekokullara birinci yıl için kayıt yaptırabilirler.

Güzel Sanatlar Fakültesi ve Beden Eğitimi ve Spor Yüksekokulu’ndaki tüm bölümler ve Resim-İş Eğitimi ve Müzik Eğitimi bölümleri için başvuranların Üniversite tarafından belirlenen belirli yetkinlik sınavları geçmeleri gerekir.